崇祯三十八年（康熙九年）三月，郑经正式袭爵“延平王”。虽然年仅十六岁，但在林默、沈寒山、陈永华三位顾命大臣辅佐下，台湾政局平稳过渡。
　　郑经尊林默为“太师”，总揽军政；沈寒山为“太傅”，主管军事；陈永华为“太保”，负责内政外交。三人组成“摄政会”，代行王权，待郑经二十岁亲政。
　　这个安排本是最佳选择，但暗流已经涌动。
　　首先是军中。老一代将领如郑彩、郑泰等人，对郑经这个“孺子”并不完全服气。他们认为自己跟随郑成功出生入死，如今却要听命于一个十六岁少年，心中难免不平。尤其是郑彩，他是郑成功堂弟，论资历、战功，都觉得自己更有资格主政。
　　其次是文官系统。张溥等老臣年事已高，逐渐淡出；新一代官员多是台湾本土培养，对林默、陈永华这些“大陆派”把持朝政，私下颇有微词。他们认为台湾已自成体系，何必总惦念大陆？
　　最麻烦的是，清廷得知郑成功死讯，认为时机已到。康熙皇帝（时年十五岁，即将亲政）召集群臣商议，决定对台湾采取“剿抚并用”之策：一面派使者招抚，许以“靖海王”世袭；一面命福建总督加紧备战，准备趁台湾内乱之际一举攻台。
　　五月，清廷使者抵达台湾。郑经召集摄政会商议。
　　“王爷，”林默率先开口，“清廷这是试探。若我们接受招抚，他们就会得寸进尺，要求削发称臣；若我们拒绝，他们就有了进攻的借口。”
　　郑经问：“太师以为该如何？”
　　“虚与委蛇。”林默道，“可以接见使者，表示愿意和谈，但条件要苛刻：一要清廷承认台湾为大明治下，二要去除剃发令，三要归还福建沿海之地。清廷必然不允，那时再拒绝，我们就有理有据。”
　　沈寒山点头：“还要在此期间加紧备战。我估计，最迟明年，清军就会来犯。”
　　陈永华补充：“另外，可暗中联络三藩，特别是吴三桂。若清军攻台，让他至少在云南有所动作，牵制清军兵力。”
　　计议已定。次日，郑经在承天府接见清使。使者宣读圣旨，封郑经为“靖海王”，要求削发归顺。
　　郑经依照林默所教，从容道：“台湾本是大明国土，我父受永历皇帝册封为延平王，世镇台湾。今上国若愿承认台湾自治，去剃发之令，归还闽南沿海，本王愿与上国和平共处，永为藩篱。”
　　使者脸色一变：“世子此言，是不愿归顺了？”
　　“不是不愿，是不能。”郑经道，“身体发肤，受之父母；国土疆域，受之先帝。二者皆不可弃。若上国不能答应，请回禀贵主：台湾虽小，敢战之心不泯。”
　　谈判破裂。使者悻悻而归，临走前撂下狠话：“世子年少，莫要误判形势。我大清雄兵百万，踏平台湾易如反掌！”
　　郑经冷笑：“那我就在台湾，恭候王师。”
　　送走清使，台湾进入全面备战。但就在这时，内部矛盾爆发了。
　　六月，郑彩在厦门（郑成功死后，郑家重新控制厦门、金门等沿海岛屿）召集旧部，秘密商议。参与的有郑泰、郑联之子郑缵绪等一批老将。
　　“经儿年幼，被林默、陈永华这些文人操控，长此以往，郑家基业恐落外人之手。”郑彩愤愤道，“我等跟随大哥（郑成功）多年，如今却要看这些文人的脸色，岂有此理！”
　　郑泰犹豫：“但大哥临终前指定他们为辅政……”
　　“那是大哥病重，受人蒙蔽！”郑彩道，“如今大哥已去，我们这些叔父，理应主持大局。我打算以‘清君侧’为名，率军回台湾，让经儿亲政——当然，实际由我们这些老臣辅佐。”
　　有人担忧：“林默、沈寒山手握兵权，陈永华掌控情报，我们……”
　　“兵权？”郑彩冷笑，“水师大半是我的旧部。陆师中，许多将领也是我从讲武堂带出来的学生。至于沈寒山，一个残废，有何可惧？”
　　密议持续到深夜。最终决定：七月初，郑彩以“巡防”为名，率水师主力回台湾，控制安平港，逼宫摄政会。
　　然而他们不知道，陈永华的情报网已经渗透到军队高层。密议的第二天，消息就送到了安平镇。
　　“郑彩要反。”陈永华将密报放在林默案头。
　　林默看后，长叹一声：“终究还是来了。侯爷生前最担心的，就是身后内乱。”
　　沈寒山坐在轮椅上，面色铁青：“郑彩这是找死。王爷（郑经）虽然是他的侄子，但更是君。以下犯上，罪不容诛！”
　　“但他是侯爷的堂弟，军中元老。”林默道，“若强硬镇压，恐寒了老臣之心，也可能引发军队分裂。”
　　“那怎么办？难道让他逼宫成功？”
　　林默沉思良久：“先礼后兵。王爷是君，他是臣，我们先以君臣大义劝他。若不听……再动兵不迟。”
　　他立即求见郑经，将情况如实禀报。
　　十六岁的郑经听完，沉默良久。他想起父亲生前教导：为君者，当恩威并施，但涉及根本，不可手软。
　　“太师打算如何处置？”郑经问。
　　“臣建议，王爷亲笔写封信给郑彩，以侄儿身份，动之以情；以君主身份，晓之以理。若他悬崖勒马，仍不失为国之柱石；若执迷不悟……就只能军法从事了。”
　　郑经点头：“就依太师。但信要怎么写，还请太师指点。”
　　林默口述，郑经亲笔：
　　“彩叔父台鉴：侄经泣血再拜。父王新丧，侄年幼继位，蒙叔父及诸位长辈辅佐，方得政局安稳。今闻叔父欲率军回台，侄心惶恐。若为军务，侄自当亲迎；若为他故，还请叔父明言。”
　　“父王在日，常言：‘郑家以忠义立身，万不可内讧相残’。今清虏虎视，大敌当前，若我郑家自乱，岂不正中虏计？侄虽年幼，亦知‘兄弟阋于墙，外御其侮’之理。恳请叔父以大局为重，以郑家为重，以台湾百万生灵为重。”
　　“若叔父对侄或摄政诸臣有所不满，尽可直言。侄必虚心纳谏，有则改之，无则加勉。郑家基业，乃父王与叔父等血战所得，侄岂敢不敬？万望叔父三思。”
　　信写完后，郑经盖上延平王印，交陈永华密送厦门。
　　与此同时，林默和沈寒山也做了军事准备。沈寒山秘密调讲武堂学生军官控制的三个镇进驻安平镇周边，又令郑经的亲军营加强戒备。林默则通过陈永华的情报网，暗中接触郑彩部下的将领，分化瓦解。
　　七月初五，信送到厦门。郑彩看后，勃然大怒：“黄口小儿，也敢教训我！”他认定这是林默的主意，更加坚定了“清君侧”的决心。
　　但军中已出现分裂。郑泰看了信后，犹豫道：“经儿说得在理。如今清军随时可能来犯，我们若内讧，确实……”
　　“二哥，你糊涂了！”郑彩道，“正因为大敌当前，才不能让文人误国！林默、陈永华之流，懂什么打仗？让他们掌权，台湾必亡！”
　　争论中，一些将领开始动摇。他们跟随郑彩是想求富贵，但若背上叛逆之名，甚至导致台湾内战，那就得不偿失了。
　　七月初十，郑彩不顾劝阻，率水师百艘、兵两万，向台湾进发。但他不知道，舰队中已有陈永华安插的人，随时可以发动兵变。
　　七月十二，舰队抵达澎湖。郑彩下令休整一夜，次日进攻鹿耳门。
　　当夜，变故发生。
　　深夜，郑彩的旗舰“镇海号”上忽然起火，火药库被炸。混乱中，一群士兵冲进指挥舱，擒住了郑彩。
　　“你们……你们反了？”郑彩又惊又怒。
　　为首的将领是刘国轩——他早已被陈永华暗中策反。“郑将军，得罪了。末将不能看着台湾内战，让亲者痛仇者快。”
　　“刘国轩，我待你不薄！”
　　“正因如此，末将才要阻止将军铸成大错。”刘国轩正色道，“王爷虽然年幼，但仁德英明，更有林太师、沈太傅辅佐，台湾前景光明。将军若一意孤行，只会让郑家基业毁于一旦。请将军为郑家着想，为台湾着想。”
　　郑彩看着周围，都是刘国轩的人，知道大势已去，长叹一声：“罢了……罢了……”
　　兵变成功。刘国轩控制舰队，将郑彩软禁，同时派人飞报台湾。
　　七月十五，消息传到安平镇。郑经既欣慰又伤感。欣慰的是内战避免了，伤感的是郑家终究出了叛逆。
　　“郑彩该如何处置？”沈寒山问。
　　林默道：“他是侯爷堂弟，又是元老，不宜公开治罪。不如……削去兵权，赐宅软禁，让他安度晚年。如此既保全了郑家颜面，也警示了其他人。”
　　郑经同意。但他补充一点：“郑彩的部下，除首恶外，一律赦免，仍任原职。特别是刘国轩，护国有功，当重赏。”
　　处理完内乱，台湾暂时安定。但更大的危机接踵而至。
　　八月，清廷得知台湾内乱（虽然很快平息），认为时机成熟。康熙皇帝在鳌拜支持下，下诏“平台”，命福建总督集结水陆大军，准备攻台。
　　而这一次，清军的主帅不再是施琅，也不是姚启圣，而是新一代名将——满洲正黄旗都统，年仅二十八岁的费扬古。
　　费扬古是顺治皇帝的表侄，少年从军，曾参与平定三藩之乱（历史上三藩之乱发生在康熙十二年，此处因剧情需要提前），作战勇猛，深得康熙信任。他到任福建后，立即着手整顿水师，建造新船，招募熟悉海战的汉人水手。
　　更关键的是，费扬古带来了全新的战略。他没有像施琅那样急于求成，而是提出了“三步走”计划：第一步，占领澎湖，建立前进基地；第二步，长期围困台湾，断绝其外援；第三步，待台湾内乱或粮尽时，一举攻占。
　　“郑经年幼，台湾主少国疑，必有内患。”费扬古在军事会议上说，“我们不必急于求成，只要断了他们的海上贸易，困上两年，台湾不攻自乱。”
　　这个战略很毒辣。台湾虽然粮食可自给，但盐铁、火药、白银都需要贸易。若被长期封锁，经济必然崩溃。
　　九月，清军开始行动。费扬古亲率两百艘战船攻占澎湖，郑家守军不敌，退守台湾。清军在澎湖大兴土木，修建永久性工事和港口，显然是要长期驻扎。
　　消息传到台湾，人心惶惶。澎湖是台湾门户，失守意味着台湾暴露在清军刀锋之下。
　　郑经紧急召开军事会议。众将议论纷纷，有的主张立即反攻，夺回澎湖；有的主张固守待援，等清军来攻。
　　林默却提出不同看法：“费扬古的战略是围困，那我们就要打破围困。如何打破？不是正面强攻，而是……”
　　他走到海图前：“清军主力在澎湖，福建沿海必然空虚。我们可以派精锐舰队北上，直捣福州、泉州，逼费扬古回援。同时，派人联络吴三桂，让他在云南起事，牵制清军西南兵力。”
　　沈寒山赞同：“围魏救赵，好计。但北上舰队需勇将领军。”
　　“刘国轩。”林默道，“他熟悉福建沿海，又有反正之功，正需要机会证明自己。”
　　郑经最终同意。九月二十，刘国轩率五十艘精锐战船、五千精兵，悄然北上。他们的目标不是攻城略地，而是袭扰清军后方，焚毁船厂、码头，制造混乱。
　　与此同时，陈永华派密使再赴云南，催促吴三桂履行盟约。
　　一场决定台湾命运的大战，即将拉开序幕。
　　而年轻的郑经，将在这场大战中，真正成长为一代王者。