崇祯二十一年（清顺治五年）秋，台湾迎来了又一场丰收。
　　盐田扩张至两万亩，年产盐两千万斤，不仅自足，还远销日本、吕宋。屯田开垦达百万亩，粮食储备可支三年。人口增至四十万，市井繁荣，学堂遍地。
　　但在一片兴盛中，暗流悄然涌动。
　　九月，安平镇突发瘟疫。起初只是几人发热、呕吐，以为是寻常风寒。但十日之内，染病者增至数百，死亡过百。症状相似：高烧不退，浑身起红疹，咽喉溃烂。
　　“是天花？还是鼠疫？”陈一手带着弟子奔走于病患之间，面色凝重。
　　林默紧急下令：封锁疫区，设立隔离营，全城熏艾消毒。但疫情仍在蔓延。更可怕的是，军中有士兵感染，若传入军营，后果不堪设想。
　　郑成功亲临隔离营视察。看着营内痛苦的百姓，他问陈一手：“陈神医，可有良方？”
　　陈一手摇头：“此疫凶猛，老朽行医五十年，未曾见过。目前只能以清热解毒之药缓解，但治标不治本。”
　　旁边一个年轻的军医忽然开口：“师父，弟子记得您提过，西洋医书中有种‘人痘’之法，可防天花。此疫虽非天花，但原理或许相通？”
　　说话的是吴郎中，沈寒山的主治医师，如今已是军医总监。
　　陈一手眼睛一亮：“你是说……以毒攻毒？取疫者脓浆，接种于健康者，使其轻症感染，获得免疫？”
　　“正是。”吴郎中道，“弟子曾与荷兰医者交流，他说在泰西，此法已试行多年。”
　　郑成功皱眉：“此法治本？”
　　“可防，不可治。”吴郎中老实道，“且风险极大，若接种不当，反致重症。但如今疫情蔓延，或可一试。”
　　林默在一旁听着，忽然想起前世的知识：这不是牛痘吗？虽然人痘风险大，但在没有牛痘的十七世纪，这或许是最佳选择。而且他知道历史——人痘法在中国早有雏形，只是未推广。
　　“陈神医，吴先生，我有一法。”林默道，“取康复者的痘痂，研磨成粉，吹入健康者鼻腔。剂量从轻到重，分次接种。如此可降低风险。”
　　陈一手思索片刻：“此法……或可一试。但需志愿之人。”
　　“我来。”郑成功毫不犹豫。
　　“不可！”众人大惊，“侯爷万金之躯，岂能犯险？”
　　“我若不试，如何让百姓信服？”郑成功正色道，“况且，我身体强健，纵有风险，也能扛住。”
　　陈一手还在犹豫，林默却道：“侯爷，您是三军统帅，不可轻动。还是让我来吧——我自幼体弱，若我能承受，则健者无忧。”
　　最终商定：林默、吴郎中及十名死囚（自愿者可免死）作为第一批接种者。
　　接种在隔离营旁的医馆进行。陈一手亲自动手，将康复者的痘痂粉吹入林默鼻腔。整个过程庄严肃穆，所有人屏息凝神。
　　接下来是漫长的等待。林默被隔离在单独的房间，每日由陈一手诊脉观察。前三日无事，第四日开始低烧，身上出现少量红疹。这正是免疫系统在工作的迹象。
　　第七日，红疹消退，烧退。林默康复了！
　　“成功了！”陈一手老泪纵横，“林先生，你为台湾立下大功！”
　　消息传出，万民振奋。第二批接种扩大到百人，包括郑成功、陈永华等核心人员。九成以上获得免疫。
　　接着是全军接种，再是全城百姓。至十月，疫情基本控制。台湾成为当时世界上第一个大规模实施人痘接种的地区，死亡率从三成降至不足一成。
　　经此一疫，台湾的医疗体系彻底革新。陈一手主持编纂《东都医典》，收录中西医术；设立“医学堂”，培养医者；建立“惠民药局”，平价售药。吴郎中因功升任医政使，专司防疫。
　　疫情刚过，又一件事摆上桌面：沈寒山的伤势。
　　在四重溪疗养半年后，沈寒山伤势稳定，但彻底告别了战场。这位曾经叱咤风云的虎将，如今只能挂着拐杖行走，每到阴雨天，旧伤便疼痛难忍。
　　林默多次探望，每次都见沈寒山对着地图出神，手指在上面划着想象中的进军路线。
　　“沈兄，可是寂寞了？”一次，林默问道。
　　沈寒山苦笑：“说不寂寞是假。但这就是命吧。只是……总想做点什么，不能白吃饭。”
　　林默心中一动。他想起前世那些退伍军人的转业安置问题。沈寒山这样的名将，岂能就此埋没？
　　“沈兄，我倒有个想法。”林默道，“台湾如今军队五万，但缺乏系统的军事教育。年轻将领有勇无谋，有谋无勇。我想办一所‘讲武堂’，请你出任总教习，将毕生所学传授后人。”
　　沈寒山眼睛亮了：“讲武堂？”
　　“对。挑选军中俊才，系统教授兵法、阵图、火器、海战。不光学打仗，也学治军、学为将之道。”林默道，“沈兄虽不能上阵，但培养出的将领，将来都是你的学生。他们的功劳，就是你的功劳。”
　　沈寒山激动得手发抖：“好！这个差事，我接了！”
　　郑成功得知后，大加赞赏：“沈将军传道授业，功在千秋！”他亲自选址，在安平镇东侧划地百亩，兴建讲武堂。又下令：凡营级以上将领，必须轮流听课；每期学员百人，学期半年，优者提拔。
　　崇祯二十二年春，讲武堂正式开学。沈寒山坐着轮椅登上讲台，面对台下百名年轻军官，声音洪亮：
　　“今日第一课，不讲兵法，只讲两个字：为何而战。”
　　他缓缓扫视众人：“你们有人为报仇，有人为功名，有人为吃粮。这些都没错。但我要告诉你们：我们在这台湾，不是为了苟活，不是为了割据。我们是为了保住华夏衣冠，保住祖宗留下的文明。”
　　“清军可以占我们的地，杀我们的人，但他们改不了我们的文字，变不了我们的血脉。只要台湾还在，只要还有人在读四书五经，在写汉字，在穿汉服，华夏就没有亡！”
　　“你们将来带兵打仗，要记住：你们守护的不是一座城、一块地，而是一个文明。这是比性命更重的东西！”
　　台下鸦雀无声，许多年轻人眼中含泪。
　　从那天起，讲武堂的校训就刻在石碑上：“护衣冠，传文明，复山河。”
　　沈寒山找到了新的人生意义。他虽不能骑马提枪，但坐在轮椅上指点江山，培养出一批批优秀将领。后来郑成功反攻大陆时，主力将领多出自讲武堂第一期，这是后话。
　　讲武堂的成功，启发了林默。他又向郑成功提议：设立“格物院”，专研技艺。
　　“侯爷，我们与清军相比，优势在于火器、造船、航海。但这些优势若不发展，迟早被追上。”林默道，“格物院可招揽巧匠，研究中西技艺，改良军械农具。这是百年大计。”
　　郑成功深以为然。崇祯二十二年夏，格物院在安平镇西落成。院中分设机械、火药、造船、农具、天文数科。林默亲自兼任院长，陈永华、吴郎中以及几位西洋传教士担任教习。
　　格物院的第一项成果，是改良了红衣大炮的炮架，使其可快速转向，提高了舰炮的射击效率。第二项成果，是改进了纺纱机，使台湾的棉布产量翻倍。第三项，是根据西洋钟表原理，制作了更精确的航海计时器。
　　这些成果看似微小，但累积起来，让台湾的军事实力、经济实力稳步提升。
　　崇祯二十二年秋，台湾迎来了开台以来最好的年景：粮食丰收，盐铁充足，市舶繁荣，人口突破五十万。安平镇已扩建三次，城墙周长达十五里，城内街道纵横，店铺林立，有了“小金陵”之称。
　　重阳节，郑成功登高远望。看着脚下繁华的城池，远处连绵的盐田、稻田，港口如林的帆樯，他感慨道：“三年，短短三年啊。林先生，还记得我们刚来台湾时吗？那时只有热兰遮城几座破屋，城外尽是荒草。”
　　林默也感慨：“是啊。但侯爷，这还不是终点。”
　　“我知道。”郑成功望向西北，“大陆的百姓，还在受苦。永历皇帝困守云南，李定国独木难支。清廷已基本平定中原，接下来，必定全力对付我们。”
　　“所以我们要抓紧时间。”林默道，“我估计，最多还有两年平静。两年后，清军必大举来犯。”
　　“两年……”郑成功握紧剑柄，“够了。两年后，我们要让清军知道，台湾，是他们永远跨不过的天堑！”
　　两人正说着，陈永华匆匆赶来：“侯爷，林先生，细作急报！”
　　展开密信，两人脸色同时一变。
　　信上说：清廷已与荷兰东印度公司再签密约，荷兰将派遣四十艘战舰、两百门重炮助清攻台。作为交换，清廷许以台湾、澎湖的贸易独占权。荷兰舰队预计明年春抵达。
　　更坏的消息是：施琅被重新启用，加封“靖海将军”，全权负责攻台事宜。他正在福建大肆造船练兵，据说已造新舰百艘。
　　“该来的还是来了。”郑成功沉声道，“这次，是决死之战。”
　　林默却摇头：“未必。侯爷，荷兰人重利，清廷许的只是空头承诺——台湾在我们手里，他们拿什么给荷兰人？我们或许……可以反间。”
　　“反间？”
　　“对。派人联络荷兰东印度公司巴达维亚总部，陈明利害：助清攻台，他们能得到什么？一块需要血战才能拿到的土地？而我们，可以许以现实的利益——开放台湾贸易，降低关税，允许他们设立商馆。只要他们保持中立。”
　　郑成功思索：“荷兰人会信吗？”
　　“荷兰是商人之国，利益至上。”林默道，“况且，澎湖一败，他们损失惨重，内部必有反对再战之声。我们只需要……给他们一个台阶下。”
　　郑成功最终同意。林默亲自执笔，用拉丁文、荷兰文写了三封信：一封给荷兰东印度公司总督，一封给荷兰议会，一封给即将来台的舰队司令。信中详陈利害，许以优惠贸易条件。
　　信件由精通荷语的传教士送往巴达维亚。同时，郑成功下令：全军进入战备状态。
　　崇祯二十二年冬，台湾在备战中度过。讲武堂加开速成班，格物院全力生产军械，盐田昼夜开工储备物资。百姓也动员起来，男丁编入民防，妇女赶制军衣。
　　紧张的气氛中，一个好消息传来：唐夫人有喜了。
　　郑成功年近三十得子，全台欢庆。弘光皇帝亲自赐名，若为男，则名“经”；若为女，则名“媛”，取“经纬天地”、“媛德流芳”之意。
　　次年（崇祯二十三年）正月，唐夫人顺利产下一子。郑成功抱着婴儿，泪流满面：“我儿，你生在这台湾，是为父的幸事，也是你的责任。将来，你要守护这片土地，守护这华夏最后的衣冠。”
　　婴儿啼哭声响彻总兵府。那一刻，所有人都感到，一种传承正在延续。
　　二月，荷兰方面回信了。
　　信使带回的并非正式国书，而是一封密信。荷兰东印度公司总督表示：考虑到与郑家的长期利益，决定只派十艘战舰“象征性参战”，实际保持中立。但要求郑家承诺：战后开放安平、鸡笼为通商口岸，关税减半。
　　“成了！”林默长舒一口气。
　　郑成功也松了口气，但随即道：“荷兰人虽中立，但施琅那边压力依旧。而且，十艘荷兰战舰仍在，不可不防。”
　　“有这十艘，和四十艘，天差地别。”林默道，“现在，我们可以专心对付施琅了。”
　　三月，施琅完成备战。清军水师三百艘，陆战兵五万，号称十万，誓师伐台。出征前，施琅立下军令状：“不取台湾，誓不回还！”
　　大战，一触即发。
　　而台湾这边，郑成功已做好迎战准备。他做出了一个重大决策：放弃外岛，诱敌深入，在台湾本岛与敌决战。
　　“我要让施琅进来，然后关起门来打狗！”郑成功在海图上重重一拍。
　　崇祯二十三年四月，清军舰队出现在澎湖海域。
　　这一次，没有遭遇抵抗。郑家军已撤出澎湖，退守台湾本岛。
　　施琅顺利占领澎湖，但他没有贸然进攻，而是在澎湖休整，同时派船侦查台湾防务。
　　侦查结果让他心惊：台湾沿海，炮台林立，棱堡棋布，完全是一个武装到牙齿的要塞。更可怕的是，郑家水师主力不见踪影——他们藏在哪？
　　施琅不知道的是，郑成功将水师主力分成了三支：一支在台湾以东的太平洋上待命，一支在台湾海峡南部，一支在台湾北部。而陆地上，五万大军已进入预设阵地。
　　一张天罗地网，已经张开。
　　就等清军，登陆。